Los principales rubros del costo de los proyectos de Metro son la infraestructura, los equipos electromecánicos y los trenes (material rodante) a los que se le agregan otros costos relacionados del proyecto como pueden ser el traslado de redes, obras de urbanismo y paisajismo y obras complementarias en los corredores por donde pasa el trazado del Metro. El costo total de la línea fue estimado en 2016 en $9,74 millones de pesos colombianos, para la longitud de 25,3 kilómetros. A una tasa de cambio de $3,150 pesos por dólar, esto arroja un costo de $159 millones de dólares por kilómetro.
Según estudios que han recopilado costos de construcción de sistemas Metro alrededor del mundo, han encontrado que los costos por kilómetro han variado de nivel de 22 millones de dólares, para el proyecto Hannover U-Bahn, hasta 438 millones de dólares el proyecto London Jubilee Line extension. Para mayor detalle por favor referirse al estudio Flyvbjerg, Bruzelius & Van Wee (2008), Comparison of Capital Costs per Route-Kilometre in Urban Rail. Lo anterior muestra que los costos de un proyecto de este tipo varían ampliamente y que depende sustancialmente de las características de cada proyecto, tanto de los componente que incluye cada proyecto, como de aspectos netamente locales como las condiciones del suelo, los aspectos sísmicos, los costos de suministros y de construcción. Sí se ha encontrado en otros estudios (World Bank Urban Transport Strategy Review - Mass Rapid Transit in Developing Countries, Final Report Halcrow Fox,2000 ) que los costos de un Metro elevado son en promedio entre 2-2,5 veces superiores los de un metro a nivel, mientras que los costo de un metro subterráneo son en promedio entre 4-6 veces superiores a los de un Metro a nivel.
